鯨魚擱淺經常發生，有時是一條，有時是集體，形成一幕幕慘不慰睹的情景．從古至今，鯨魚擱淺都在發生，而原因眾說紛紜，下面列舉了最廣為接受的原因．

返祖論
 

鯨魚是哺乳類動物，用肺呼吸．其實鯨魚祖先本來就是陸上動物，所以，有人認為鯨魚擱淺是返祖的原因．在鯨魚發展的過程中，不免有經過兩棲時期，當時，鯨魚一旦在海遇到危險，就會走到陸上．這種習慣延至今天，當鯨魚覺得正處危險時，就會流露出這種原始的行為，走到陸上躲避，導致擱淺．

回音定位

鯨類靠著靈敏的聽覺，使用回音定位來追尋食物，確定方向．當鯨豚因某些原因，導致回音定位失靈，或計算錯誤，令到鯨豚向陸上方向游上時，就有可能導致鯨豚擱淺．
 

群體生活的鯨豚 鯨類動物中絕大多數是社群般居住的，牠們在群中相親相愛，一旦有一條鯨豚擱淺，其他的會奮不顧身地上出救鯨，導致集體鯨豚擱淺．

地磁論
 

鯨豚類有依靠地磁性來辨別方向的能力，而一旦在鯨豚體內的地磁方向感應失靈，或受到破壞（如污染），就會導致鯨豚誤認方向，游了上岸．科學家Klinowska發覺鯨魚活生生擱淺多數是在白晝，而這時也是鯨魚的地磁波被太陽的能量或其他不規的變化所相反掉．導致地磁方向引導和海岸成垂直線，鯨魚因此直游上岸．